《表3 基因注释成功率统计》

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《基于RNA-seq的铁线莲转录组信息分析》

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为获得Unigene的功能分类信息，从NR蛋白分析、GO分析、KOG分析、KEGG分析等几方面进行功能注释。组装得到的99 652条All-Unigenes分别与7个公共数据库NR、NT、Swiss-Prot、KEGG、GO、Pfam和KOG比对，结果有9 133条（9.16%）Unigenes在以上7个数据库中均注释成功（表3）。通过与Nr库比可获对取本物种基因序列与近缘物种基因序列的相似性以及本物种基因的功能信息（金剑雪，2017）。其中比对到NR数据库的60 096条Unigene中，未知基因占比最大，比对上的物种分布最多的是莲（Nelumbo Nucifera）（38.6%） ，较多的是葡萄（Vitis U-niferfera）（13.5%） ，其次是可可树（Theobroma Cacao）（3.1%） 、柑橘（Citrus Sinensis）（2.2%） 、桐油（Jatropha Curcas）（2.2%）（图1）。