《表5 15个新塔花居群psbA-trnH序列的种内遗传距离》
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《不同地理居群新塔花的ITS2和psbA-trnH序列及聚类分析》
通过对18个不同地理居群新塔花样品的psbA-trnH序列进行分析比较,有15个不同地理居群新塔花被成功测序。序列长度为355 bp,但是XTH6序列长度为349 bp,177-182碱基位置缺失6个碱基。除XTH6的G+C含量为28.65%外,其他地理居群的G+C含量均为28.45%。当空位(gap)做为碱基缺失处理时,序列检测变异位点数共9个,其中1处缺失/插入片段,8处为碱基置换(4处颠换:1处T→C,1处C→T,1处A→G,1处G→A;4处转换:4处T→A)。保守位点有347 bp,占序列总长度97.75%,序列相似程度在98%~100%,共有4个单倍型,其中XTH1,XTH3,XTH4,XTH5,XTH7,XTH8,XTH10,XTH11,XTH13,XTH16属于单倍型Ⅰ1,XTH14,XTH17,XTH18属于单倍型Ⅰ4,见表4。K2P遗传距离计算显示不同地理居群来源新塔花样品psbA-trnH的遗传距离变化为0~0.023,其中,XTH1与XTH3,XTH4,XTH5,XTH6,XTH7,XTH8,XTH10,XTH11,XTH13,XTH16遗传距离最小,为0;XTH3与XTH4,XTH5,XTH6,XTH7,XTH8,XTH10,XTH11,XTH13,XTH16遗传距离最小,为0;XTH4与XTH5,XTH6,XTH7,XTH8,XTH10,XTH11,XTH13,XTH16遗传距离最小,为0;XTH5与XTH6,XTH7,XTH8,XTH10,XTH11,XTH13,XTH16遗传距离最小,为0;XTH6与XTH7,XTH8,XTH10,XTH11,XTH13,XTH16遗传距离最小,为0;XTH7与XTH8,XTH10,XTH11,XTH13,XTH16的遗传距离最小,为0;XTH8与XTH10,XTH11,XTH13,XTH16遗传距离最小,为0;XTH10与XTH11,XTH13,XTH16遗传距离最小,为0;XTH11与XTH13,XTH16遗传距离最小,为0;XTH13与XTH16遗传距离最小,为0;XTH14,XTH17,XTH18遗传距离为0,均与除XTH12外的其他11个新塔花的遗传距离最大,为0.023。见表5。
图表编号 | XD00181121500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.20 |
作者 | 苏艳、程波、何江、杨伟俊 |
绘制单位 | 新疆农业大学食品科学与药学学院、新疆维吾尔自治区药物研究所新疆维吾尔药重点实验室、新疆维吾尔自治区药物研究所新疆维吾尔药重点实验室、新疆维吾尔自治区药物研究所新疆维吾尔药重点实验室、新疆维吾尔自治区药物研究所新疆维吾尔药重点实验室 |
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