《表4 trnH-psbA序列的种间遗传距离》

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《基于trnH-psbA和matK序列的油茶种子DNA条形码鉴定》


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用MEGA 5.05软件基于K2P(Kimura-2-parameter)模型计算各种油茶trnH-psbA序列的种内及种间遗传距离(表4;表5)。理想的DNA条形码序列其种间距离应该大于种内距离,普通油茶与其他油茶的最小种间遗传距离为0.004 cM,而普通油茶的平均种内遗传距离为0.002 cM,最大种内遗传距离为0.003 cM,最大种内距离均小于最小种间距离,表明trnH-psbA序列能将普通油茶与其他油茶进行有效区分。而越南油茶与香花油茶、高州油茶的种间遗传距离均为0,无法将这三者进行区分。总之,将trnH-psbA序列作为DNA条形码可将普通油茶与其他的油茶种类进行有效鉴别,但无法区分海南油茶、高州油茶与香花油茶。