《表2 差异基因富集前10的代谢通路》

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《纸皮核桃内果皮硬化期差异表达基因筛选及功能预测》


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KEGG由KEGG genes,KEGG Ligand,KEGG pathway和KEGG BRITE 4个数据库共同构成,利用KEGG数据库可以研究细胞中基因、生化分子和蛋白质的功能、生化反应以及代谢途径。本研究中有个191 Unigene富集到了79个Pathway中(图8),富集度排在前10的Pathyway有植物激素信号转导(Plant hormone signal transduction),内质网蛋白加工(Protein processing in endoplasmic reticulum),ABC转运子(ABC transporters),胞吞作用(Endocytosis),植物-病原互作(Plant-pathogen interaction),剪接体(Spliceosome),苯丙烷类生物合成(Phenylpropanoid biosynthesis),苯丙氨酸代谢(Phenylalanine metabolism),角质、丝氨酸和蜡质生物合成(Cutin,suberine and wax biosynthesis),泛醌和其他萜类醌生物合成(Ubiquinone and other terpenoidquinone biosynthesis)。其中,转录因子BIM1基因CL169.Contig7_All、丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶SAPK3基因Unigene28134_All、乙烯受体2基因Unigene18324_All、生长素响应因子3基因CL447.Contig4_All、组氨酸激酶2基因CL4024.Contig3_All等参与植物激素信号转导通路;ABC转运子通路中基因CL2824.Contig3_All参与ATP结合盒转运因子合成,基因CL9312.Contig1_All、Unigene27245_All、CL3278.Contig2_All分别参与ABC家族A、B、C 3类转录因子合成;CL2405.Contig5_All、Unige-ne24904_All、CL2983.Contig6_All、Unigene7110_All等基因参与苯丙烷生物合成通路、苯丙氨酸代谢通路中苯丙氨酸裂解酶、辅酶A连接酶、酰基转移酶、酰基-辅酶A合成酶、过氧化物酶的合成(表2)。