《表3 5个物种转录组组装情况表》

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《基于基因组和转录组数据的甲壳类系统发育研究》


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使用Trinity对下载自NCBI的棕虾、粉红色虾、日本对虾、长毛对虾以及凡纳滨对虾的转录组数据进行组装,得到Unigene数量分别为11 747、118 427、68 077、12 778和41 397条。其N50大小分别为659、484、1 532、511、1 397 bp,具体见表3。从结果中我们可以得到,日本对虾和凡纳滨对虾的N50值比较大,组装结果质量好,尤其是日本对虾,其N50值达到1 532 bp。