《表1 物种数据信息见表:基于基因组和转录组数据的甲壳类系统发育研究》

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《基于基因组和转录组数据的甲壳类系统发育研究》


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本研究共分析了节肢动物门的11个物种,除染色大绒螨Dinothrombium tinctorium为蛛形纲以外,其余物种均为甲壳纲。甲壳纲的10个物种中,棕虾Penaeus aztecus、粉红色虾Penaeus duorarum、日本对虾Penaeus japonicus、长毛对虾Penaeus penicillatus以及凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei等5种对虾所用序列为转录组数据经过de novo组装、蛋白翻译后的氨基酸序列,转录组原始数据下载自NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)。而葛氏长臂虾Palaemon gravieri为舟山近海海域采样所得,我们采集鳃和肌肉组织送生物公司测序得到其转录组数据。甲壳纲的真宽水蚤Eurytemora affinis、端足虫Hyalella azteca、蚤状蚤Daphnia pulex和鼠妇Armadillidium vulgare以及蛛形纲的染色大绒螨等5个物种为基于基因组数据翻译的蛋白序列,这些蛋白序列均下载自NCBI,具体信息见表1。