《表3 5种基于高通量测序技术的系统发育基因组学数据获取方法的比较》

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《系统发育基因组学方法研究进展》

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从当前系统发育基因组学分析在国内外的发展状况来看，简化基因组测序和目标序列捕获技术是当前系统发育基因组学研究获取数据的两个主要技术手段.相比而言，目标序列捕获技术对DNA质量要求更低，可对捕获目标区域、分子标记的数目及长度进行选择，几乎适用所有的生物类群，且捕获效率高、数据回收速度快、数据集的缺失率低，适合不同阶元的系统发育分析，具有更好的发展前景.简化基因组测序在高阶元进化分析中数据缺失率较高，但可以有效解决复合种及种下水平的系统发育关系和系统地理学问题.研究者应该考虑不同方法的优缺点与适用范围（表3），选择合适的数据获取方法来开展研究工作.