《表1 基于16S r DNA基因的7对常用细菌高通量测序通用引物及来源》

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《水稻种子内生细菌16S rDNA基因高通量测序PCR引物筛选和菌群结构分析》

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16S r DNA基因序列包括9个可变区和10个保守区，保守区序列反映了物种间的亲缘关系，而可变区序列则能体现物种间的差异。但因为测序平台读长的限制，目前市场上、文献中多数使用的区域是V3～V4区或者V4～V5等。根据文献（Her‐lemann et al.，2011；Yamamoto et al.，2010；陈泽斌等，2017；Vasileiadis et al.，2012；Bates et al.，2011；Xiong et al.，2012；Yu et al，2013）报道选择7对细菌高通量测序常用引物作为候选引物，序列及来源如表1，并将7对候选引物之间位置关系和扩增区段示于图1。