《表2 转录本组装:外源因子处理下蓝莓不同发育阶段果实的转录组分析》
注:N50代表序列从大到小排列,当其累计长度刚刚超过全部序列总长度50%时,最后一个序列的大小即为N50的大小;N90代表序列从大到小排列,当其累计长度刚刚超过全部序列总长度90%时,最后一个序列的大小即为N90的大小
采用组装软件Trinity对Clean Data进行组装,组装出全长转录本序列,并基于转录本序列,取每个基因中最长的转录本序列作为Unigene,得到统计结果(表2)。组装得到227 725条转录本序列,总碱基数为168 242 764 bp,GC含量为43.37%,N50长度为1 062 nt,N90长度为324 nt,平均长度为738.8 nt。Unigene总数为87 608条,总碱基数为66 025 609 bp,GC含量为43.06%,N50为1 101 nt,N90长度为326 nt,最小长度为201 nt,最大长度为15 586 nt,平均长度为753.65 nt (图1)。Unigene的长度分布表明转录本组装的完整性较高。
图表编号 | XD00194431300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.14 |
作者 | 彭舒、袁玮、张婷渟、杨芩 |
绘制单位 | 凯里学院大健康学院、凯里学院大健康学院、凯里学院大健康学院、凯里学院大健康学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |