《表1 木聚糖酶基因序列分析》

《表1 木聚糖酶基因序列分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《玉米皮纤维发酵培养裂褶菌的转录组分析和重组α-L-阿拉伯呋喃糖苷酶的异源表达》


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Unigene序列分别与NR、NT数据库进行BLAST比对分析,分别有7 281和1 559个能够比对成功,占总数目的30.78%和6.59%。Unigene序列分别进行BLASTP和BLASTX分析后,有7 353和7 084个能够比对成功,占总数的31.08%和29.95%。分析显示,共有5个作用于玉米皮半纤维素主链的木聚糖酶基因(表1),分别属于糖苷水解酶第10家族和第11家族,木聚糖酶基因在687~1 113 bp之间。玉米皮半纤维素的彻底降解需要多种酶的协同作用[18],而半纤维素主链的降解同样需要多种木聚糖酶的协同作用。有研究显示,通过裂褶菌基因组测序分析能够预测到6个木聚糖酶基因[19],其中5个为糖苷水解酶的第10家族,1个为第11家族。转录组测序分析预测木聚糖酶基因数量少于基因组测序分析数量,可能是由于在本研究的培养条件下,某些木聚糖基因没有转录或转录水平低造成的。按序列同源性,木聚糖酶分别属于糖苷水解酶第10家族、11家族和5家族,属于同一家族的木聚糖酶催化区域具有同源性。第10家族的木聚糖酶分子量高,结构复杂,主要作用于支链,通常生成较小的低聚糖;第11家族主要作用于主链,对木聚糖有很高的特异性;第5家族只作用于有阿拉伯糖集合的位点[20-21]。