《表1.验证OWVT-1与USA-87-5的序列使用的引物》

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《食线虫真菌洛斯里被毛孢线粒体基因组的再分析》

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利用MAFFT version 7软件（http://mafft.cbrc.jp/alignment/server/）对组装完成的OWVT-1的线粒体基因组与公布的USA-87-5的线粒体基因组（KU203675）进行比对，比对结果用Mauve 2.3.1软件进行展示[27]。为便于序列比对，将公布的USA-87-5线粒体基因组序列的起点调整到与OWVT-1一致（即rnl基因前15 bp处）。对OWVT-1和USA-87-5的线粒体基因组比对存在差异的区域，根据两端的保守序列设计引物（表1），然后通过PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳确认两个菌株间是否确实存在差异。为了进一步确认USA-87-5的线粒体基因组序列，利用专门的线粒体基因组组装软件MITObim 1.9[28]从USA-87-5的高通量测序数据中重新组装线粒体基因组。