《表1 扩增使用的引物序列》

《表1 扩增使用的引物序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《抗病毒治疗病毒学失败的HIV感染/AIDS患者基因型耐药发生情况及其影响因素》


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患者发生病毒学失败时立即进行耐药检测。采集患者肘静脉血5 m L,3 000 r/min离心15 min后取上层血浆。采用Nucli SENS@mini Mag@核酸提取系统(生物梅里埃中国有限公司)从血浆中提取HIV RNA,反转录为DNA后采用巢式PCR的方法扩增HIV-1 pol区基因片段,扩增范围为HIV-1 pol区蛋白酶基因全序列和反转录酶1~219位密码子序列,扩增使用的引物序列见表1。第一轮PCR反应总体系为25μL,运行程序:50℃30 min,95℃5 min;94℃30 s,55℃30 s,72℃2 min 30 s,30个循环;72℃10 min。第二轮PCR反应总体系为50μL,运行程序:94℃5 min;94℃30 s,63℃30 s,72℃2 min 30 s,30个循环;72℃10 min。制备浓度为0.8%~1.0%琼脂糖凝胶,然后吸取5μL PCR产物加入上样孔,以5 V/cm电压电泳20~30 min后,将凝胶置于凝胶成像分析仪(上海培清科技有限公司,型号:TS-3000)内观察结果。将扩增阳性产物送北京博迈德科技发展有限公司进行测序,之后采用ChromasPro 1.3软件对序列进行编辑、拼接和校正。将合格的序列提交到斯坦福大学艾滋病病毒耐药数据库(http://hivdb.stanford.edu)进行耐药性分析。该数据库将耐药程度分为敏感、潜在耐药、低度耐药、中度耐药、高度耐药5个水平,本研究将低度及以上耐药性定义为基因型耐药[6]。