《表1 本研究中所使用的引物》
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《圆斑星鲽(Verasper variegatus)wt1基因的克隆与表达分析》
从山东省烟台天源水产有限公司采集圆斑星鲽不同发育时期的胚胎,包括单细胞期(卵裂前胚盘隆起时期)(0h)、2细胞期(4h)、8细胞期(10h)、16细胞期(12h)、32细胞期(13h)、桑椹期(18h)、高囊胚期(20h)、低囊胚期(26h)、原肠早期(27h)、原肠中期(29h)、原肠晚期(77h)、神经胚期(98h)、晶体形成期(136h)、心跳出现期(163h)、孵化前期(188h)、脱膜孵化期(197h),不同时期的仔稚鱼(孵化后5d,10d,20d,30d,45d,58d,68d,78d,92d)及雌雄成鱼[体长(24.0±0.5)cm,体重(330±20)g]的不同组织(脑、眼、鳃、心、肝、肠、脾、性腺、肾及肌肉),将采集的样品用液氮充分研磨,根据Trizol(Ta Ka Ra)实际说明书提取各组织的总RNA,经Thermo紫外分光光度计(Nano Drop 2000)和1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测,将高质量的RNA用SMARTTM RACE c DNA Amplification RACE(Ta Ka Ra)试剂盒分别合成3’RACE和5’RACE c DNA。之后根据本实验室构建的转录组数据库获得wt1a和wt1b基因的EST序列,利用Primer Primer 5.0软件设计wt1a和wt1b基因的3′RACE和5′RACE特异性引物(表1),以圆斑星鲽成鱼性腺组织c DNA为模板分别进行扩增,PCR反应体系(20μL)为:Premix TaqTM (LA TaqTM Version 2.0)10μL、3’或5’特异性引物0.8μL、UPM(或NUP)0.8μL、RACE-c DNA 1μL及dd H2O 6.4μL。PCR反应条件为:94°C 5min;94°C 30s,3’或5’特异性引物温度30s,72°C 1min,35个循环;72°C 10min。扩增产物经1.2%琼脂糖凝胶电泳检测,并在紫外线下切胶,并用San Prep柱氏DNA凝胶回收试剂盒回收,利用PMD18-T Vector试剂盒(Ta Ka Ra)进行连接(PMD18-T Vector 1μL,Solution I 5μL及纯化产物4μL),16°C反应3h。之后将连接液加入融化好的DH5α(Code No9057,Ta Ka Ra)中培养,挑取阳性单克隆,经菌落PCR鉴定后,筛选目的菌液送至华大基因进行测序。
图表编号 | XD00187945200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.01 |
作者 | 杨珍珍、边力、张岩、陈四清、常青、张盛农、刘长琳、葛建龙 |
绘制单位 | 中国水产科学研究院黄海水产研究所、上海海洋大学水产与生命学院、中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
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