《表2 携带TGFBR3稀有错义突变患者的基因型与临床信息》
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《TGFBR3错义突变与先天性心脏病遗传关联性研究》
注GERP:基因组进化速率评测,1 KG:千人基因组数据库,GenomAD:基因组聚集数据库,ASD:房间隔缺损,TOF:法洛四联症,DORV:右心室双出口,PH:肺动脉高压,NA:无数据
TGFBR3基因外显子的深度靶向测序分析发现3个独立存在的CHD特有的突变:TGFBR3 c.2054A>G(p.K685R)、TGFBR3c.2372C>T(p.A791V)和TGFBR3 c.2410G>T(p.A804S),以下分别简称为TGFBR3K685、TGFBR3A791V和TGFBR3A804S。Sanger测序进一步验证显示这3个突变均为杂合突变(图1A)。与千人基因组(1KG),Ex AC和Gnom AD等数据库数据比较结果显示:TGFBR3K685R在三个数据库中均未有报道,属于新发突变,而TGFBR3A791V和TGFBR3A804S是在亚洲人群中未有报道的稀有突变(Gnom AD数据库中在总人群中突变频率分别为3.18×10-5和7.96×10-6),并且被预测为有害突变(表2)。突变TGFBR3K685R位于蛋白胞外Zona Pellucida结构域(ZP domain),突变TGFBR3A791V和TGFBR3A804S位于跨膜结构上(图1B)。3个突变处编码对应的氨基酸在脊椎动物中高度保守(图1C)。
图表编号 | XD00113037100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.25 |
作者 | 吕昕、王红艳、张斌 |
绘制单位 | 复旦大学生命科学学院、复旦大学生命科学学院、复旦大学附属妇产科医院、复旦大学附属妇产科医院 |
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