《表1 菜粉蝶基因组中鉴定得到的气味结合蛋白和化学感受蛋白》

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《菜粉蝶气味结合蛋白和化学感受蛋白生物信息学分析》

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“无”表示没有预测到信号肽。“None”indicated that no signal peptide was predicted.

通过对菜粉蝶基因组数据库的本地BLAST搜索和Hmmer在线蛋白家族预测软件分析，我们得到了24个OBPs基因蛋白序列（表1），我们对这24个蛋白依次命名为Pr OBP1-PrOBP24。除Pr OBP18缺失N端外，其余OBPs都为全长。Pr OBPs的氨基酸大小差异很大，最短的有113个氨基酸，最长的有168个氨基酸，平均长度为141个氨基酸。通过SignalP 4.1在线网站预测我们发现，除了Pr OBP1、Pr OBP2、Pr OBP3、Pr OBP5、Pr OBP6、Pr OBP14、Pr OBP15、Pr OBP16外，其他Pr OBPs的N端都有信号肽。利用与OBPs相同的搜索方法，我们在菜粉蝶的基因组数据库中得到了38个CSPs基因蛋白序列全长（表1）。我们对这38个蛋白依次命名为Pr CSP1-PrCSP38。昆虫CSPs的序列比较保守，蛋白序列长度相差不大。Pr CSPs蛋白氨基酸的平均长度为121个。通过SignalP 4.1在线网站预测发现，所有鉴定出的Pr CSPs在N端都有信号肽。