《表1 野桑蚕Hippo通路关键基因蛋白的鉴定》

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《野桑蚕Hippo通路核心基因的鉴定与序列比较分析》


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注:序列一致性等指标为野桑蚕序列与家蚕同源序列比对结果。所使用的家蚕同源蛋白GenBank登录号为sav(NP_001296512.1)、mob(XP_004926597.1)、yki(AHJ26003.1)、sd(XP_021204829.1)、warts(XP_004923559.1)

通过序列比对和同源鉴定,在野桑蚕转录本中获得了salvador(sav)、warts(wts)、mats、yorkie(yki)和scalloped的核酸序列,并预测ORF框和编码蛋白。结果表明,野桑蚕sav开放阅读框长度为1 209 bp,编码402个氨基酸,与家蚕同源基因一致性为99.50%;warts开放阅读框长度为3 078 bp,编码1 025个氨基酸,同家蚕同源基因一致性为100.00%;mats开放阅读框长度为654 bp,编码蛋白包括217个氨基酸残基,与家蚕同源基因一致性为98.84%;yki开放阅读框长度为1 314 bp,编码437个氨基酸,与家蚕同源基因一致性为89.02%;scalloped基因开发阅读框为1 239 bp,编码蛋白包含412个氨基酸残基,与家蚕同源基因一致性为79.13%(表1)。各蛋白的亲水性平均系数均小于0,表明均为亲水性蛋白。在野桑蚕转录本中未拼接得到hpo同源基因。