《表3 关键基因的KEGG通路分析》
应用Cytoscape(版本3.6.1)软件的插件cyto Hubba对差异基因筛选出节点度>10的关键基因,共筛选出19个关键基因,其中上调基因有18个,分别是AURKA、CDC6、WDHD1、OIP5、MCM4、NCAPH、RAD51AP1、CEN-PF、FEN1、CDC7、NEK2、DSCC1、PAX6、KIF18A、CASP1、ICAM1、COL1A1、COL3A1,下调基因有1个,为FMOD。应用DAVID对19个关键基因进行GO富集分析及KEGG通路富集分析,筛选出基因数≥5的GO富集分析,结果显示关键基因主要富集在蛋白结合、核浆、细胞核和细胞周期、DNA复制,见表2、表3。应用UCSC数据库对关键基因构建的层次聚类图结果显示,PAX6和FMOD在正常组织样本中高表达,CDC6和NEK2在肿瘤组织中高表达,关键基因可以基本区分甲状腺癌样本和正常样本(图4)。
图表编号 | XD00196717600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.30 |
作者 | 陈妹妹、梁瑜祯、李争明、夏宁 |
绘制单位 | 广西医科大学第一附属医院内分泌科、广西医科大学第二附属医院内分泌科、广西医科大学第二附属医院内分泌科、广西医科大学第一附属医院内分泌科 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |