《表3 排名前3位的子模块中中枢基因的KEGG通路分析》

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《糖尿病相关hsa-miR-223-3p靶基因预测及生物信息学分析》

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将预测得到的靶基因数据上传到STRING数据库中，获得靶基因对应的PPI网络。研究[20]显示，2个或2个以上的蛋白质会通过非共价键形成蛋白复合体，且蛋白质之间的相互作用越多则该蛋白质越重要。利用STRING构建PPI网络后，将PPI评分>0.9作为阈值条件，通过Cytohubba插件筛选出连接度排名前30的节点。由于第30和第31个节点的连接度均为21，故最终纳入连接度≥21的31个节点为中枢基因。利用MCODE插件筛选出PPI中评分排名前3位的子模块（图3），并通过DAVID数据库对模块中的中枢基因进行KEGG通路分析，结果显示模块1的靶基因主要富集于泛素介导的蛋白水解作用，模块2的靶基因主要参与RNA转运和细胞周期，模块3的靶基因主要参与内吞作用（表3）。