《表1 模块A~E的GO生物过程与KEGG信号通路分析结果(排序前3位)》

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《半夏泻心汤“异病同治”抑郁症和溃疡性结肠炎的药理作用机制研究》


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4.网络模块识别与分析 将上述.TSV列表导入Cytoscape软件中,运用MCODE Cluster插件工具进行模块划分,涉及39个节点,171条边,最终获得5个关键网络模块,62个靶标,其中最大的网络模块由17个作用节点靶标组成,这些模块所包含的节点靶蛋白可能是经方半夏泻心汤治疗抑郁症和溃疡性结肠炎至关重要的节点,见图3。将上述每个网络模块所含靶标分别导入DAVID工具进行GO生物过程与KEGG通路的富集分析,根据P值富集分析的显著性,表1列出每个网络模块排序前3位的生物过程与信号通路。结果显示,模块A主要与NO生物合成正向调节(positive regulation of nitric oxide biosynthetic process)有关,涉及花生四烯酸代谢通路、癌症中蛋白多糖信号通路及利什曼疾病信号通路;模块B主要与代谢通路相关,如外源代谢(xenobiotic metabolic process)、药物代谢等信号通路;模块C主要与核内NF-kappa B正向调控有关(positive regulation of NF-kappa B import into nucleus),主要涉及NF-kappa B(NF-kappa B signaling pathway)信号通路等;模块D主要与胰岛素分泌调节(regulation of insulin secretion)密切关联,主要涉及5-羟色胺能突触(serotonergic synapse)信号通路及神经活性配体-受体相互作用(neuroactive ligand-receptor interaction)信号通路等;模块E主要涉及缺氧和可卡因反应(response to hypoxia and cocaine)相关,涉及5-羟色胺能突触信号通路、Rap1(Rap1signaling pathway)信号通路等。