《表1 枳和‘资阳香橙’中鉴定和克隆的NRAMP家族蛋白信息》
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《枳和‘资阳香橙’NRAMP家族基因鉴定、克隆及响应营养逆境的表达模式分析》
以拟南芥已知的NRAMP家族蛋白序列比对甜橙基因组数据库,获得4个高度同源的甜橙NRAMP家族成员且均包含NRAMP保守结构域PF01566,因此将这4个基因确定为甜橙NRAMP基因。根据甜橙NRAMP基因序列设计引物,分别从枳和‘资阳香橙’中进行克隆。测序后根据这些序列与AtN-RAMPs序列的同源性,分别将其命名为PtNRAMPs和CjNRAMPs(表1和表2)。将PtNRAMPs和CjN-RAMPs的核苷酸序列提交GenBank,获得的基因登录号为MK012423~MK012430(表1)。枳PtN-RAMPs的ORF长度范围是1 538 bp(PtNRAMP3)至1 680 bp(PtNRAMP6.2),编码512~559个氨基酸,预测含有10~12个跨膜结构域(TM)。预测的PtN-RAMPs蛋白的MW为56.3~60.4 kDa,pI为5.0~8.6。与枳PtNRAMPs类似,资阳香橙CjNRAMPs的ORF长度范围是1 539 bp(CjNRAMP3)至1 680 bp(CjNRAMP6.2),编码512~559个氨基酸,预测含有10~12个跨膜结构域(TM)。CjNRAMPs蛋白的MW和pI的预测范围分别是56.1~60.6 kDa和5.0~8.7(表1)。
图表编号 | XD0051347400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.10 |
作者 | 黄梓洋、张晓勇、凌丽俐、淳长品、彭良志、付行政 |
绘制单位 | 西南大学柑桔研究所·国家柑桔工程技术研究中心、中国农业科学院柑桔研究所、西南大学柑桔研究所·国家柑桔工程技术研究中心、中国农业科学院柑桔研究所、西南大学柑桔研究所·国家柑桔工程技术研究中心、中国农业科学院柑桔研究所、西南大学柑桔研究所·国家柑桔工程技术研究中心、中国农业科学院柑桔研究所、西南大学柑桔研究所·国家柑桔工程技术研究中心、中国农业科学院柑桔研究所、西南大学柑桔研究所·国家柑桔工程技术研究中心、中国农业科学院柑桔研究所 |
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