《表1 Bn NRAMP1基因编码蛋白的一级结构特性预测》
分析发现Bn NRAMP 1基因的c DNA长度为2 076 bp。预测编码氨基酸为545个。预测其编码的蛋白一级结构的基本理化性质(表1),发现其相对分子质量、理论等电点、不稳定系数、Bn NRAMP1蛋白的脂溶性指数和平均亲水性分别为59.15 k D、7.54 k D、38.14 k D、117.25 k D和0.581 k D,表明该蛋白为稳定性亲水蛋白。将它与其他物种的NRAMP1氨基酸序列进行同源比较分析(图2),发现与川桑(Morus nota-%bilis)(XP_024018653)、桑树(Morus alba)(AYW016 95)、山麻黄(Parasponia andersonii)(PON57272)、木豆(Ca-%janus cajan)(XP_020232276)、野大豆(Glycine soja)(KHN31883)、枣树(Ziziphus jujube)(XP_015871870)氨基酸序列相似性分别为91.93%、91.19%、89.56%、86.42%、86.79%、87.02%。Bn NRAMP1的氨基酸序列与其它物种进行同源序列比对使用软件为MEGA5.0分析得出(图3),苎麻与川桑(XP_024018653)、桑树(AYW01695)亲缘关系最近,其次与山麻黄(PON-%57272)、山黄麻(PON80966)亲缘关系较近。
图表编号 | XD00220557400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.14 |
作者 | 尹伟丹、马玉申、汪娅梅、揭雨成、邢虎成 |
绘制单位 | 湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室、湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室、湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室、湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室、湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室 |
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