《表1 分段质谱鉴定近等基因系NIL-G和NIL-Y大豆叶片类囊体蛋白数目》

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《大豆G位点近等基因系叶片类囊体蛋白质组比较分析》

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为了提高分析结果的准确性，降低假阳性率，选取报告置信度在95%以上的蛋白并且排除分子量不在选定区域的蛋白，如表1所示，经鉴定，NIL-G中共检测到2 170种蛋白，其中分子量小于25k Da的有485种，25～45k Da的有656种，大于45k Da的有1 029种；NIL-Y中共检测到1 730种蛋白，其中分子量小于25k Da的有373种，25～45k Da的有458种，大于45k Da的有899种。NIL-G叶片类囊体中特异性表达的蛋白1 140种，NIL-Y叶片类囊体中特异性表达的蛋白700种。共检测到相同蛋白1 030种，其中表达存在差异且差异大于3倍的蛋白有68种，NIL-G叶片类囊体中含量高的有23种，NIL-Y叶片类囊体中含量高的有45种。