《表1 菌株YAUN-3 i TRAQ/TMT标记样品中鉴定蛋白的分子量分布与全基因组预测蛋白的比较》

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《厌氧产氢颗粒污泥蛋白质组分析样品的高效制备方法》

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（1） 小分子量蛋白比例减少，尤其是0-10 kD的蛋白（表1）。理论上，蛋白分子量越小，蛋白分子上的胰蛋白酶酶切位点的数量就越少，因此小分子量蛋白在酶切后得到的相应肽段数目越少，从而降低了小分子量蛋白在质谱分析中的鉴定几率[33]。这是导致i TRAQ/TMT标记样品中鉴定到小分子量蛋白比例减少的原因。