《表1 所用引物序列:水稻黄叶突变体yl(t)的鉴定与遗传分析》

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《水稻黄叶突变体yl(t)的鉴定与遗传分析》


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CAPS:酶切扩增多态性序列

从yl(t)/NPB的F2群体中随机挑取25个黄叶单株和正常绿叶单株提取DNA分别构建隐性混池和显性混池,参照分群分析法(bulked segregant analysis,BSA)(Michelmore et al.,1991)初定位yl(t);然后,从该F2群体中扩大隐性单株数量,将yl(t)精细定位至两个物理位置相近的标记之间。在MSU-RGAP数据库(http://rice.plantbiology.msu.edu)中,根据精细定位区域内的各基因蛋白产物功能信息推断候选基因;以T98B为对照,对yl(t)中的候选基因Os HO1进行测序,鉴定突变位点(引物为表1Mutepos F/R);根据突变位点序列特征,开发酶切扩增多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequences,CAPS)标记(引物为表1 CAPS-yl(t) F/R),分析突变位点与表型是否关联。