《表1 实验所用引物:Ds插入突变体的遗传学综合性实验设计与探讨》

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《Ds插入突变体的遗传学综合性实验设计与探讨》


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DsR-primer:Ds元件3′末端特异的嵌套引物;AD primer:熔解温度较低的随机简并引物;W:“A/T”碱基;N:“A/C/G/T”碱基;S:“C/G”碱基。

利用水稻的Ac/Ds双因子转座系统,筛选Ds转座插入纯合体植株为材料,采用TAIL-PCR[8]的方法扩增Ds元件旁侧的水稻基因组序列,分析Ds插入位点旁邻序列,通过序列比对确定该基因在水稻染色体上的具体位置,并对候选基因进行了分析。TAIL-PCR反应所用引物见表1,其位置示意图如图1所示,特异扩增得到的第3轮PCR产物用来测序。Ds在水稻基因组中的插入位置运用BLAST(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)分析工具完成。Ds因子插入所在位点相关基因预测信息可以在水稻基因组注释数据库获得(http://rice.plantbiology.msu.edu/)。