《表1 实验所用引物:拟南芥雄性不育突变体ms1424的鉴定与基因定位》
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《拟南芥雄性不育突变体ms1424的鉴定与基因定位》
“-”代表不适用,“N”表示有多种不同大小的PCR产物,“117 (Nde I)”为CAPS分子标记的PCR扩增产物,可被Nde I酶切成两段。
本文共涉及五种拟南芥[Arabidopsis thaliana(L.) Heynh.]材料:Columbia-0(Col-0)生态型和Landsberg erecta (Ler)生态型的野生型材料,背景为Ler生态型的ms1424和背景为Wassilewskija (Ws)生态型的cer1-6 (SALK_008544)突变体,以及ms1424和Col-0的杂交F2代分离出的ms1424。cer1-6购自ABRC,其余材料皆为本实验室所留存。如无特殊说明,则所有拟南芥均生长在相对湿度(relative humidity,RH)50%~70%、温度20~22°C的温室中,每日给予16 h光照。卡诺固定液:冰醋酸和无水乙醇按体积比1:3配制。亚历山大红染液参照Peterson等(2010)配制而成。体内萌发所用试剂同Di Giorgio等(2016),体外花粉萌发培养基的配置参照文献(Boavida和Mc Cormick 2007)。DNA提取用CTAB,2×CTAB缓冲液:20 g·L-1 CTAB,75 mmol·L-1 TrisHCl,15 mmol·L-1 EDTA,1.05 mmol·L-1 Na Cl。总RNA提取试剂:TRIzol (Invitrogen)。c DNA第一链合成:Prime ScriptTM RT reagent Kit with g DNA Eraser (Takara)。DNA聚合酶:2×Taq DNA polymerase (Novoprotein)。实验涉及的引物见表1。Nde I购自NEB。凝胶回收:Axy Prep DNA凝胶回收试剂盒。连接载体:天根生化科技有限公司的p GM-T、VT202-01。T-DNA插入突变体引物序列:SALK T-DNA primer design;CER1同源基因和CER1同源蛋白信息:Phyto Mine、NCBI、Ensembl Plants和Tair;同源蛋白序列相似性对比:NCBI Blast。系统进化树用MEGA的10.0.5版本计算得出,alignment为Clustal W,系统进化树为Maximum Likelihood Tree,Test of Phylogeny选择Bootstrap method,Replications为1 000次,其余为默认参数。
图表编号 | XD00229585500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.20 |
作者 | 陈万利、莫翱溦、姚远、许鹏辉、陆平利 |
绘制单位 | 复旦大学生命科学学院植物科学研究所、复旦大学生命科学学院植物科学研究所、复旦大学生命科学学院植物科学研究所、复旦大学生命科学学院植物科学研究所、复旦大学生命科学学院植物科学研究所、河南大学生命科学学院省部共建作物逆境适应与改良国家重点实验室 |
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