《表1 极化曲线拟合结果:玉米籽粒突变体dek48的表型鉴定与基因定位》

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《玉米籽粒突变体dek48的表型鉴定与基因定位》


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在F2代定位群体中随机选取表型分离比正确的果穗,利用CTAB法提取48粒突变籽粒及其双亲的基因组DNA[22]。利用20 K GBTS(genotyping by target sequencing)靶向测序技术[23]分析样本基因型。计算每个多态性SNP标记的基因型频率(SNP-index),即亲本型基因型占所有F2样本基因型的频率,SNP-index越接近1,表明标记与目标基因越连锁[24]。将F2定位群体的突变籽粒数量增加至2300个,并开发6对InDel标记In6.38、In7.29、In7.39、In8.29、In8.53、In9.06(表1),缩小定位区间。开发SNP标记,利用KASP(kompetitive allele-specific PCR)基因分型技术分析重组单株基因型,完成基因精细定位。利用Gramene(http://www.gramene.org/)网站检索候选区段的基因及其功能注释。