《表1 本研究所使用的引物》
从本实验室构建的转录组数据库中查找比对获得Vvpiwil2基因部分序列,利用Primer 5.0设计引物Vvpiwil2-S1和Vvpiwil2-A1(表1),对该cDNA序列进行验证,以圆斑星鲽成鱼性腺组织的cDNA为模板进行扩增。PCR反应体系(20μl)为:Premix Taq?(LA Taq?Version 2.0)10μl、Vvpiwil2-S1(10μmol/L)0.8μl、Vvpiwil2-A1(10μmol/L)0.8μl、cDNA(1μg/μl)1μl及ddH2O 6.4μl。PCR反应条件:94℃5 min;94℃30 s,50℃30 s,72℃1 min,35个循环;72℃10 min。扩增产物经1.2%琼脂糖凝胶电泳检测,并在紫外线下切胶,之后,用SanPrep柱式DNA凝胶回收试剂盒、pMD18-T Vector试剂盒(TaKaRa)和DH5α进行纯化、连接与转化培养,挑取阳性单克隆,经菌落PCR鉴定后,筛选目的菌液送至华大基因进行测序,测序结果与原始Vvpiwil2基因cDNA序列进行比对,确定为Vvpiwil2基因的核心序列。之后根据Vvpiwil2基因的核心序列设计特异性引物Vvpiwil2-3?GSP-1、Vvpiwil2-3?GSP-2、Vvpiwil2-5?GSP-1及Vvpiwil2-5?GSP-2,利用巢式PCR反应获得目的片段,PCR反应体系(20μl):Premix Taq?(LA Taq?Version 2.0)10μl、3?或5?特异性引物0.8μl、UPM 0.8μl、RACE-cDNA 1μl及ddH2O 6.4μl。PCR反应条件:94℃5 min;94℃30 s,60℃30 s,72℃1 min,35个循环;72℃10 min。将目的片段进行切胶回收、纯化、连接、转化、挑取阳性单克隆,最终将经过菌落PCR鉴定的目的菌液送到华大基因公司测序。
图表编号 | XD00133207300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 杨珍珍、边力、张岩、常青、陈四清、刘长琳、葛建龙、胡建成、张盛农 |
绘制单位 | 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔 |
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