《表1 本研究所使用的引物》

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《圆斑星鲽piwil2基因的克隆与表达分析》


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从本实验室构建的转录组数据库中查找比对获得Vvpiwil2基因部分序列,利用Primer 5.0设计引物Vvpiwil2-S1和Vvpiwil2-A1(表1),对该cDNA序列进行验证,以圆斑星鲽成鱼性腺组织的cDNA为模板进行扩增。PCR反应体系(20μl)为:Premix Taq?(LA Taq?Version 2.0)10μl、Vvpiwil2-S1(10μmol/L)0.8μl、Vvpiwil2-A1(10μmol/L)0.8μl、cDNA(1μg/μl)1μl及ddH2O 6.4μl。PCR反应条件:94℃5 min;94℃30 s,50℃30 s,72℃1 min,35个循环;72℃10 min。扩增产物经1.2%琼脂糖凝胶电泳检测,并在紫外线下切胶,之后,用SanPrep柱式DNA凝胶回收试剂盒、pMD18-T Vector试剂盒(TaKaRa)和DH5α进行纯化、连接与转化培养,挑取阳性单克隆,经菌落PCR鉴定后,筛选目的菌液送至华大基因进行测序,测序结果与原始Vvpiwil2基因cDNA序列进行比对,确定为Vvpiwil2基因的核心序列。之后根据Vvpiwil2基因的核心序列设计特异性引物Vvpiwil2-3?GSP-1、Vvpiwil2-3?GSP-2、Vvpiwil2-5?GSP-1及Vvpiwil2-5?GSP-2,利用巢式PCR反应获得目的片段,PCR反应体系(20μl):Premix Taq?(LA Taq?Version 2.0)10μl、3?或5?特异性引物0.8μl、UPM 0.8μl、RACE-cDNA 1μl及ddH2O 6.4μl。PCR反应条件:94℃5 min;94℃30 s,60℃30 s,72℃1 min,35个循环;72℃10 min。将目的片段进行切胶回收、纯化、连接、转化、挑取阳性单克隆,最终将经过菌落PCR鉴定的目的菌液送到华大基因公司测序。