《表1 毛木耳rDNA各元件拷贝内的多态性分析》

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《毛木耳rDNA序列结构及IGS鉴别菌种初探》


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注:SNP:单核苷酸多态性;InDel:插入与缺失;SV:结构变异

毛木耳rDNA共有310个重复单元,每个单元由ETS、18S rDNA、ITS1、5.8S rDNA、ITS2、28S rDNA、IGS1、5S rDNA和IGS2等9个元件构成。不同重复单元之间各元件的多态性分析结果见表1。与其他食用菌一样,18S rDNA、ITS1、5.8S rDNA、ITS2、28S rDNA、和5S rDNA的序列高度保守。但是IGS序列与已报道的金针菇(徐伟南等2018a)、白灵菇(张金霞等2004)、香菇(吴茜2010)不同。毛木耳十分保守,即没有SV,也没有Indel,SNP也很少,特别是IGS1序列,2 247bp中仅有3个SNP,在1 400–2 200bp区域没有多态性。如果这个区段品种间存在多态性,则有望用于毛木耳品种鉴别研究。