《表4 三斑海马扩增序列分析信息》

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《三斑海马及其混伪品的DNA条形码分子鉴定研究》

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本研究对三斑海马样品的COI、16 S rRNA、ATP6基因进行了PCR扩增及测序，采用Mega 5.0软件对三斑海马基因序列GC含量，碱基变异位点、信息位点和转换/颠换等进行分析，序列分析结果见表4。其中COI序列全长为649 bp，GC平均含量为40.13%。16 S序列长度为572 bp，GC平均含量为41.97%。ATP6序列全长变化范围为603 bp，GC平均含量为36.81%。对三斑海马的COI、16SrRNA和ATP6序列的单倍型数目和变异位点分析发现，不同的条形码序列存在丰富的单倍型多样性和变异率，其中三斑海马COI序列存在7种单倍型，16 S rRNA序列存在5种单倍型，ATP6序列存在11种单倍型，提示ATP6序列在三斑海马种内存在较大的遗传多样性，可用于后续的地理和群体遗传学研究。COI序列和ATP6序列的变异位点百分比分别为1.233%和2.487%，而16S rRNA序列的变异位点最少，其百分比为0.699%。COI序列的转换值为2，不存在颠倒现象；16 S rRNA序列不存在转换和颠倒现象；ATP6转换值和颠倒值分别为3和1。