《表3 鲍氏海马扩增序列分析信息》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《基于性状鉴别与DNA条形码联用的鲍氏海马生药学研究》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

本实验对鲍氏海马样品的COI基因、16S基因和ATP6基因3个条形码序列进行了PCR扩增及测序，采用MEGA 7软件对鲍氏海马基因序列的碱基变异位点、信息位点和转换/颠换等进行分析，结果见表3。其中，鲍氏海马COI基因的序列全长在649～650 bp之间，GC碱基平均含量为41.41%；16S基因和ATP6基因的序列长度分别是574和603bp，其GC碱基平均含量分别为43.49%和35.53%。对3个条形码在鲍氏海马种内的变异率进行分析，结果表明，COI、16S和ATP6基因在鲍氏海马中均存在一定的种内变异。8个鲍氏海马样品中，COI基因种内变异位点及信息位点数为12/1，其中COI序列中有1个插入/缺失位点，11个单个碱基变异位点，变异率为1.85%，转换值和颠倒值均为2；16S基因和ATP6基因种内的变异位点及信息位点数均为2/1，变异率分别为0.35%和0.33%，转换值为1，均不存在颠倒现象。通过鲍氏海马COI、16S和ATP6序列的单倍型数目分析发现，COI的种内存在6种单倍型，16S和ATP6序列种内仅存在3种单倍型。以上结果提示，COI条形码序列在鲍氏海马种内存在一定的变异率，可用于后续的种群和地理进化关系研究，16S和ATP6序列在鲍氏海马种内的变异较小，可作为辅助条形码序列用于鲍氏海马的分子鉴定研究。