《表3 棘海马扩增序列分析信息》

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《棘海马的性状鉴别与分子DNA条形码研究》


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本研究对12个棘海马样品的COⅠ和ATP6进行了PCR和测序,利用MEGA 7对序列的碱基组成、变异位点、信息位点、颠换和转换进行分析,结果表明:12个棘海马样品的COⅠ条形码序列长度均为649 bp,GC碱基平均量为39.96%;ATP6序列长度为602~603 bp,GC碱基平均量为35.37%。其中COⅠ和ATP6序列的GC碱基平均含量均低于AT碱基平均含量。对COⅠ条形码序列的变异位点和单倍型进行分析,发现不同序列均存在丰富的变异位点和单倍型,COⅠ和ATP6序列均存在7种单倍型,COⅠ序列中有24个变异位点,ATP6序列存在16个变异位点,其序列在种内的变异率分别为3.697%,2.653%。COⅠ条形码变异位点中存在11个信息位点,其序列转换、颠换值分别为7和1;ATP6基因的变异位点中存在8个信息位点,其转换、颠换值分别为4和1,序列信息见表1,3。