《表1 差异蛋白的肽段数目和分布情况》

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《不同耐旱性甘薯柴根和块根的差异蛋白组分析》

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注:JS21NSR-JS21NTR表示正常条件下JS21的块根与柴根间的差异蛋白，JS21DSR-JS21DTR表示干旱条件下JS21的块根与柴根间的差异蛋白，JZS1NSR-JZS1NTR表示正常条件下JZS1的块根与柴根间的差异蛋白，JZS1DSR-JZS1DTR表示干旱条件下JZS1的块根与柴根间的差异蛋白，JS21NTR-JZS1NTR表

样品经LC-MS/MS检测、搜库后，筛选得到假发现率（false-discovery rate，FDR）<1%的甘薯根系差异蛋白2 003个。按照Score Sequest HT>0且peptide≥1的标准，并剔除比值为空白的数据，筛选到可信蛋白1 716个，其中在各比较组中均出现显著上调或显著下调的动态表达蛋白有819个。以此为基础，计算得到每一比较组的差异倍数（fold change，FC）和差异显著性P值，筛选各比较组差异表达蛋白（表1～3）。