《表1 Overlap PCR扩增EF-Tu基因的引物序列》

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《牛支原体EF-Tu基因的克隆表达、亚细胞定位及间接ELISA方法建立》


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下划线示限制性内切酶BamHⅠ、SacⅠ酶切位点;斜体示突变位点The restriction endonuclease cleavage sites of BamHⅠand SacⅠare expressed by underlines,and the mutation sites are represented in italics

参照Uniprot数据库中M.bovis PG45标准株Elongation factor Tu(E4PZX2)的蛋白序列,获得完整的基因序列。利用在线分析软件ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)对EF-Tu蛋白的理化性质进行预测;利用SignalP(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)预测该蛋白的信号肽;利用TMHMM2.0Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)预测该蛋白的跨膜结构;利用PROSCAN(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_proscan.html)查找该蛋白功能位点;利用SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html)对该蛋白的二级结构进行在线分析。序列分析发现该蛋白序列中有1个色氨酸密码子(TGA)在大肠杆菌中为终止密码子,运用Overlap PCR技术扩增EF-Tu全序列(将序列中的TGA突变为同义密码子TGG),在引物上、下游分别加入BamHⅠ和SacⅠ酶切位点(表1)。PCR反应体系均为:灭菌双蒸水31.5μL、5×Prime STAR Buffer(Mg2+plus)10μL、dNTP Mixture 1μL、10μmol·L-1上、下游引物各1μL、模板DNA 2μL、Prime STAR HS DNA Polymerease0.5μL。PCR反应条件:94℃预变性5min;94℃1min,55℃45s,72℃60s,反应35个循环;72℃延伸10 min;反应程序结束后,在PCR管中加入2μL普通的Taq E,轻轻振荡,混匀,瞬离,72℃反应20 min,可以在PCR产物平末端添加A尾。PCR产物利用DNA回收试剂盒回收与pMD19-T载体进行连接,连接体系总体积为10μL:灭菌双蒸水4μL,SolutionⅠ1μL,加A尾的EF-Tu PCR产物4μL,pMD19T1μL,16℃过夜连接。取连接产物5μL转化至大肠杆菌50μL感受态细胞Trans T1,通过菌液PCR和双酶切鉴定为阳性的质粒送上海生工生物工程股份有限公司测序,通过NCBI在线比对,将测序正确的质粒命名为pMD19T-EF-Tu。