《表2 实时荧光定量PCR引物序列表》
为了验证测序结果的可靠性,选取了10个m RNAs (包括后续分析所得模块中的核心m RNA,VSIG4、C1QC、CD36和SPP1)和4个lnc RNA进行实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,q RT-PCR)验证。纳排标准与前期测序的样本一致,能有效保证实验结果的可靠性。根据Ensemble (http://asia.ensembl.org/index.html)提供的序列,使用在线引物设计网站Primer3Plus (http://www.primer3plus.com/cgi-bin/dev/primer3plus.cgi)设计引物,并通过BLAST(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=Blast Search&LINK_LOC=blast hom e)进行引物特异性验证。以Triz ol法提取总RNA,使用逆转录试剂盒(大连Ta Ka Ra公司)反转录为c DNA。以此c DNA为模板进行实时荧光定量PCR(美国Thermo Fisher公司),引物序列见表2。以GAPDH作为内参基因,使用2–ΔΔCt法计算两组中差异表达m RNAs和lnc RNAs的相对表达量。
图表编号 | XD00227590100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.01 |
作者 | 张悦、冯颖、马芳 |
绘制单位 | 四川大学华西第二医院教育部“妇儿疾病与出生缺陷”重点实验室、四川大学华西基础医学与法医学院、四川大学华西第二医院教育部“妇儿疾病与出生缺陷”重点实验室、四川大学华西第二医院妇产科 |
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