《表1 本研究所用到的寡核苷酸引物》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《八肋游仆虫NMD途径因子的生物信息学分析及分子鉴定》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

对鉴定到的这些NMD相关蛋白因子进行结构域注释（图3）。八肋游仆虫UPF1与人类UPF1的相似度为40%，与嗜热四膜虫UPF1a的相似度为43%，与嗜热四膜虫UPF1b的相似度为23%。S/T模体（motifs）是UPF1上蛋白激酶SMG1的磷酸化修饰位点，在八肋游仆虫、嗜热四膜虫以及酵母UPF1蛋白中均没有人类UPF1蛋白C末端的S/T模体，并且在这三种生物细胞中也都没有找到SMG1蛋白因子。八肋游仆虫UPF2具有3个MIF4G结构域，与人类UPF2蛋白相似度为18%，与嗜热四膜虫UPF2蛋白相似度为17%；鉴定到的八肋游仆虫的四种外显子连接复合体组分蛋白因子eIF4AIII、MAGO、Y14和UAP56中，前三种是EJC核心蛋白组分，其与人类相应的因子相比，相似度分别为65%、67%、41%和59%；与嗜热四膜虫相比，相似度分别为67%、68%、36%和45%。加工体（processing body，P-body）是真核生物细胞中mRNA降解的场所[19-20]，从八肋游仆虫基因组中分别鉴定到的P-body组分蛋白有XRN1、POP2和DCP2。这三种蛋白与人类同源蛋白相似度分别为24%、38%和19%。外切体（exosome）在mRNA去腺苷酸化后会沿着5′→3′的方向降解mRNA[21]，八肋游仆虫外切体蛋白与人类外切体9相似度为22%。PABP(poly A binding pro‐tein）蛋白与Poly(A）尾巴的结合对于维持mRNA的稳定性以及无义mRNA的识别至关重要[22]，八肋游仆虫PABP蛋白与人类PABP蛋白的相似度为23%。