《表1 本研究中用到的寡核苷酸引物》
用表1所示的寡核苷酸引物,从提取的土壤微生物DNA中扩增cbb M、amylase、cellulase基因.PCR扩增程序见文献[13-15].将扩增到的3个基因分别连接到克隆载体p MD-18T上,经酶切和PCR鉴定,并进行测序分析.得到的重组质粒p MD-cbb M、p MD-cellulase和p MD-amylase作为实时定量PCR(q PCR)分析的标准品.建立cbb M、amylase和cellulase基因拷贝数PCR扩增标准曲线.首先使用Tecan 200Pro酶标仪测定质粒DNA浓度,根据目的片段长度和质粒浓度计算cbb M、amylase和cellulase质粒的拷贝数,分别为2.849×l08,2.858×l08,2.998×l08copies/ng.将构建好的质粒按10倍浓度进行梯度稀释后,作为质粒标准品与其它样品模板一起扩增,从而得到样品中功能基因的拷贝数.cbb M基因标准曲线的相关系数R2=1.000,斜率为-3.404,扩增效率E=96.7%;amylase基因标准曲线的相关系数R2=0.999,斜率为-3.868,扩增效率E=81.4%;cellulase基因标准曲线的相关系数R2=0.999,斜率为-3.355,扩增效率E=98.6%.
图表编号 | XD00228598000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.20 |
作者 | 李毳、乔沙沙、刘晋仙、柴宝峰 |
绘制单位 | 山西财经大学资源环境学院、山西大学黄土高原研究所黄土高原生态恢复山西省重点实验室、山西大学黄土高原研究所黄土高原生态恢复山西省重点实验室、山西大学黄土高原研究所黄土高原生态恢复山西省重点实验室 |
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