《表1 RT-qPCR引物信息》
随机选取6个DEG(5个上调基因和1个下调基因)进行RT-qPCR验证.其中,上调基因分别为:铁载体转运蛋白酶编码基因(KZZ91599.1)、核糖体生物发生蛋白酶编码基因(KZZ88689.1)、核糖体生物合成ATP酶RIX7编码基因(KZZ97232.1)、ABC转运体编码基因(KZZ88904.1)和Fe3+ABC转运蛋白底物结合蛋白编码基因(KZZ89047.1);下调基因为:铁载体转录因子SreA酶编码基因(KZZ89485.1).根据所选DEG的序列信息,利用Primer Primer 6软件设计特异性的上游(F)引物和下游(R)引物,委托上海生物工程有限公司进行引物合成.选择球囊菌5.8srRNA基因(GenBank:U68313.1)作为内参.利用RNA抽提试剂盒(天漠生物,中国)分别提取孢子和菌丝的总RNA,利用oligo(dT)引物进行反转录得到相应的cDNA,作为模板进行RT-qPCR.RT-qPCR反应体系(20μL)包含:SYBR Green Dye 10μL,F引物1μL,R引物1μL,DNA模板1μL,DEPC水补至20μL.进行PCR扩增,反应条件:95℃1min,95℃15s,55℃60s,共40个循环,溶解曲线默认系统程序.采用2-△△Ct法计算DEG在AaM vs AaS比较组的相对表达量.每个反应进行3次生物学重复和3次技术重复.最后利用GraphPad Prism 7软件进行qPCR结果的检验及绘图.本研究使用的引物序列信息详见表1.
图表编号 | XD00193998000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.28 |
作者 | 蒋海宾、杜宇、范小雪、王杰、祝智威、范元婵、熊翠玲、付中民、徐国钧、陈大福、郭睿 |
绘制单位 | 福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学蜂产品加工与应用教育部工程研究中心、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学蜂产品加工与应用教育部工程研究中心、福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)、福建农林大学蜂产品加工与应用教育部 |
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