《表1 RT-qPCR引物》
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《沙福芽孢杆菌氧化磷酸化通路相关基因对锰胁迫的应答》
以沙福芽孢杆菌(Bacillus safensis KTCC)的全基因组序列为模板,设计5个基因的特异性引物(表1)。提取细菌总RNA,反转录成cDNA,经PCR扩增得到目的基因片段,连接pGEM-T Easy载体,转化感受态大肠杆菌DH5α,于50 mg/L氨苄青霉素的固体LB平板筛选阳性克隆,提取测序正确的克隆菌株质粒,以10倍梯度稀释作为DNA模板,绘制标准曲线,计算扩增效率。RT-qPCR的扩增程序:95℃预变性,15 min;95℃变性,10 s;63℃,30s;40个循环数;溶解曲线的设置为95℃,15 s,55℃,15 s,95℃,0.5 s。以16S r RNA为内参基因[24],采用2-ΔΔCt方法[25]计算基因的相对表达量。为减少样品之间的误差,每个样品重复测定3次。
图表编号 | XD00147859600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.22 |
作者 | 龙红、牛熙、黄世会、冉雪琴、王嘉福 |
绘制单位 | 贵州大学农业生物工程研究院、贵州大学动物科学学院、贵州大学农业生物工程研究院、贵州大学动物科学学院、贵州大学农业生物工程研究院、贵州大学动物科学学院、贵州大学农业生物工程研究院、贵州大学动物科学学院、贵州大学农业生物工程研究院、贵州大学动物科学学院 |
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