《表1 RT-qPCR引物》

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《沙福芽孢杆菌氧化磷酸化通路相关基因对锰胁迫的应答》


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以沙福芽孢杆菌(Bacillus safensis KTCC)的全基因组序列为模板,设计5个基因的特异性引物(表1)。提取细菌总RNA,反转录成cDNA,经PCR扩增得到目的基因片段,连接pGEM-T Easy载体,转化感受态大肠杆菌DH5α,于50 mg/L氨苄青霉素的固体LB平板筛选阳性克隆,提取测序正确的克隆菌株质粒,以10倍梯度稀释作为DNA模板,绘制标准曲线,计算扩增效率。RT-qPCR的扩增程序:95℃预变性,15 min;95℃变性,10 s;63℃,30s;40个循环数;溶解曲线的设置为95℃,15 s,55℃,15 s,95℃,0.5 s。以16S r RNA为内参基因[24],采用2-ΔΔCt方法[25]计算基因的相对表达量。为减少样品之间的误差,每个样品重复测定3次。