《表1 RT-qPCR验证使用的引物信息》

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《意大利蜜蜂响应东方蜜蜂微孢子虫胁迫的免疫应答》


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为了验证全转录组测序数据的可靠性,随机选取6个DEG(TCONS_00035591、TCONS_00021864、XM_006569665.2、TCONS_00030754、XM_003251768.3和XM_016912533.1)进行RT-q PCR验证。参照郭睿等[21]的方法,利用DNAMAN软件根据所选DEG的碱基序列设计相应的特异性引物,委托上海生工生物工程有限公司进行合成,相关引物信息详见表1。利用RNA抽提试剂盒(Ta Ka Ra公司,中国)分别提取Am7CK、Am7T、Am10CK和Am10T样品的总RNA,以Oligo (dT)23作为引物进行反转录,得到对应的c DNA,作为DEG和内参基因actin的qPCR模板。反应体系(20μL)包含上下游向引物(10.0μmol·L-1)各1μL,c DNA模板DNA 1μL,SYBR Green Dye 10μL,DEPC水7μL。反应在QuantStudio荧光定量PCR仪(ThermoFisher公司,美国)上进行,按照SYBR Green Dye试剂盒(Vazyme公司,中国)操作说明书上的方法,每个反应进行3次重复。反应条件:95℃预变性1 min,95℃变性15 s,60℃退火30 s,共40个循环,最后72℃延伸45 s。利用2-ΔΔCt法对上述DEG的相对表达量进行计算。通过GraphPad Prism软件进行相关数据分析及绘图。