《表2 研究circRNA翻译能力常用的数据库》
借助计算机科学、深度测序和生物信息学分析,研究人员研发了多个人性化、可视化的circRNA数据库(表2)。它们将多个物种的circRNA的序列、可变剪切的方式、亚细胞定位、甲基化修饰和编码能力等信息进行了汇总。2016年,Chen等[48]开发了circRNAdb数据库,其是首个汇总人类可编码蛋白的circRNA信息的数据库,可以根据基因名称查询相应circRNA的ORF、蛋白特征、外显子数目、IRES和m6A基序等信息。但是,几大数据库也存在一些不足,需要进一步完善,比如各数据库对circRNA没有进行统一命名,不便于跨数据库查询circRNA信息,各数据库具有物种局限性,对非模式生物的circRNA信息收录很少。
图表编号 | XD00176370200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.01 |
作者 | 郑帅龙、李利、张红平 |
绘制单位 | 四川农业大学动物遗传育种研究所、四川农业大学动物遗传育种研究所、四川农业大学动物遗传育种研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |