《表1 PCR扩增引物序列》

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《贵州不同地区番茄红酸理化、风味和细菌群落比较分析》


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参照E.Z.N.A.Soil DNA Kit(Omega Bio-tek,Norcross,GA,U.S.)说明书对样品进行DNA抽提,使用1%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA的提取质量,使用NanoDrop 2000测定DNA浓度和纯度;使用2轮引物对16SrRNA基因V5~V7可变区进行PCR扩增,引物序列见表1。扩增程序:95℃预变性3min,15个循环(95℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸45s),然后在72℃稳定延伸10min,最后在4℃进行保存(PCR仪:ABI GeneAmp 9700型)。PCR反应体系:5×TransStart FastPfu缓冲液4μL,2.5mmol/L dNTPs2μL,上游引物(5μmol/L)0.8μL,下游引物(5μmol/L)0.8μL,TransStart FastPfu DNA聚合酶0.4μL,模板DNA 10ng。