《表1 PCR扩增引物序列》

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《内蒙古地区全沟硬蜱细菌群落结构及多样性分析》


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收集纯化基因组DNA,16SrDNA基因通用引物PCR扩增。按指定测序区域,合成带有5′454A、B接头-特异引物3′的融合引物,细菌核糖体16S rDNA基因保守区域中包括了V1、V2、V3和V4 4个高变区,PCR扩增引物为V3保守区通用引物(表1),A为测序端,在通用引物外侧加入标签Tag序列以区分数据,B端引物可共用。扩增产物纯化后,连接A和B接头,Adaptor A(5′GCCTCCCTCGCGCCATCAG-3′)和Adaptor B(5′GCCTTGCCAGCCCGCTCAG-3′),使用磁珠筛选去除接头自连片段;片段筛选,保留一端是A接头、一端是B接头的片段;氢氧化钠变性,产生单链DNA片段。