《表1 qRT-PCR验证基因选择及引物设计》

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《利用RNA-seq分析诱导性系统抗性(ISR)产生时匍匐翦股颖转录因子的表达变化》

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用测序得到的各库clean reads映射（map）于组装得到的参考转录组，然后使用DEGseq对各Unigene在各库的reads数量（均一化后）进行分析，以|log2（foldchange）|>1，qvalue<0.005为阈值选取差异表达基因。使用iTAK[15]（http:∥bioinfo.bti.cornell.edu/tool/itak）软件查找所有差异表达基因中的转录因子。选取抗病相关转录因子基因20个，引物设计见表1，使用SYBR Green染料进行荧光定量PCR，利用ΔΔCT法得到各基因在各植物样本中的表达量。20mL反应体系，SYBR 10m，上下游引物各0.8mL，模板5mL，去离子水3.4mL。反应条件95℃10min；40cycles为95℃15s，57℃1min。