《表1 基因克隆及qRT-PCR引物序列》

《表1 基因克隆及qRT-PCR引物序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《苹果脂氧合酶基因MdLOX1a的同源克隆与功能验证》


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于NCBI(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov)查找Md LOX1a基因序列及起始密码子上游的启动子序列,编码该蛋白的基因序列号为LOC103411221,设计基因上下游引物F(5′-ATGTTGCACAACCTGCTTG-3′)和R(5′-TTAGATAGAGACGCTGTTGGGA-3′)(表1),以c DNA为模板利用RT-PCR(RT-PCR,reverse transcription-PCR)技术克隆编码区全长。设计启动子上下游引物F(5′-TCGGGAGGAAAAATCGGGT-3′)和R(5′-TGTGTTCTAGTTTCCAAGAACTAATTAAGC-3′)(表1),以DNA为模板利用RT-PCR技术扩增。具体反应体系:14.5μL ddH2O、5μL 5×HF Buffer、2.5μL 10 mmol/L dNTP、1μL模板、上下游引物各1μL、0.5μL酶。MdLOX1a的RT-PCR克隆程序为:98℃30 s;98℃10 s,58.5℃30 s,72℃120 s,35个循环;72℃10 min。MdLOX1a启动子的扩增程序同上,仅第2阶段孵育30 s时温度设为60℃。扩增产物经电泳回收目的条带,连接pLB(VT205)载体送测序。通过Expasy网站对MdLOX1a蛋白进行理化性质分析,用NCBI网站进行MdLOX1a基因组结构的构建,使用MEGA 5.1软件构建系统进化树,并用PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/htmL/)数据库对MdLOX1a部分启动子的顺式作用元件进行预测。