《表1 生菜光响应基因的同源基因基本信息及qRT-PCR引物序列》

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《基于转录组测序的不同光学分光膜下生菜叶片的基因表达差异分析》


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提取与测序同批的生菜样品总RNA,用PrimeScriptTM RT Reagent Kit gDNA Eraser(TaKa-Ra)试剂盒反转录成cDNA。利用IDT(Integrated DNA Technologies)进行引物设计,Primerdesign进行引物校正,引物序列见表1。实时荧光定量PCR体系采用iTaqTM Universal SYBR Green Supermix(BIO-RAD)和CFX96TM Real-Time System检测系统,反应程序如下:50℃2 min,95℃10 min,95℃15 s,60℃1 min,共35个循环。对随机选取10个DEGs进行表达分析,以Lsactin为内参基因[4],以普通玻璃板覆盖的为对照,采用2-??CT估算待测差异基因的表达水平。