《表1 靶基因qRT-PCR引物序列》
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《邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯对罗非鱼肝脏转录组影响研究》
用于进行qRT-PCR分析的实验鱼肝脏组织提取总RNA,逆转录后进行实时荧光定量PCR实验.使用Primer Primeir 5软件,根据转录组相关基因的序列设计基因特异引物(表1).这些基因主要包括免疫相关基因[凝血因子(CF),转铁蛋白(TF),补体因子B(CF-B),甘露糖结合凝集素丝氨酸蛋白酶(MBLSP),补体C3(CC3),溶酶体膜蛋白(LMP)],脂类代谢相关基因[脂肪酸羟化酶结构域蛋白(FAH-DCP),Δ-6-脂肪酰基脱氢酶(δ6-FAD),二酰甘油-O-酰基转移酶(2AOA),过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ),酰基-CoA去饱和酶(A-COA-D)]以及生殖内分泌相关基因[胞浆磺基转移酶(C-SULT),透明带精子结合蛋白(ZPSBP),卵黄蛋白原(VL),细胞色素P450 3A40(CYP4503A),类固醇21-羟化酶(S21-H)].在实验中以罗非鱼持家基因延伸因子elongation factor-1α(EF-1α)为内参照.数据处理首先用EF-1α作为内标基因对其他研究基因表达量进行标准化,计算△CT值.以对照组作为参照因子(calibrator),其倍数变化为1,DEHP处理组基因表达差异相对于参照因子基因表达的倍数为2-ΔΔCT.每个样品设置6个生物学重复,并进行3次技术重复,对这些目标基因进行定量分析,计算DEHP处理后基因差异表达倍数.数据结果用(平均值±标准差)表示,并与RNA-seq测序后相关基因表达量进行比较.
图表编号 | XD0047230300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.20 |
作者 | 张林宝、胡莹、陈海刚、贾晓平、蔡文贵 |
绘制单位 | 中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室、中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室、中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室、中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室、中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室 |
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