《表1 靶基因qRT-PCR引物序列》

《表1 靶基因qRT-PCR引物序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯对罗非鱼肝脏转录组影响研究》


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用于进行qRT-PCR分析的实验鱼肝脏组织提取总RNA,逆转录后进行实时荧光定量PCR实验.使用Primer Primeir 5软件,根据转录组相关基因的序列设计基因特异引物(表1).这些基因主要包括免疫相关基因[凝血因子(CF),转铁蛋白(TF),补体因子B(CF-B),甘露糖结合凝集素丝氨酸蛋白酶(MBLSP),补体C3(CC3),溶酶体膜蛋白(LMP)],脂类代谢相关基因[脂肪酸羟化酶结构域蛋白(FAH-DCP),Δ-6-脂肪酰基脱氢酶(δ6-FAD),二酰甘油-O-酰基转移酶(2AOA),过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ),酰基-CoA去饱和酶(A-COA-D)]以及生殖内分泌相关基因[胞浆磺基转移酶(C-SULT),透明带精子结合蛋白(ZPSBP),卵黄蛋白原(VL),细胞色素P450 3A40(CYP4503A),类固醇21-羟化酶(S21-H)].在实验中以罗非鱼持家基因延伸因子elongation factor-1α(EF-1α)为内参照.数据处理首先用EF-1α作为内标基因对其他研究基因表达量进行标准化,计算△CT值.以对照组作为参照因子(calibrator),其倍数变化为1,DEHP处理组基因表达差异相对于参照因子基因表达的倍数为2-ΔΔCT.每个样品设置6个生物学重复,并进行3次技术重复,对这些目标基因进行定量分析,计算DEHP处理后基因差异表达倍数.数据结果用(平均值±标准差)表示,并与RNA-seq测序后相关基因表达量进行比较.