《表2 ABCpred程序初步预测筛选肽段的分析》

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《羊口疮病毒安徽株121基因的原核表达与生物信息学分析》


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运用DNAStar软件中的Protean程序预测B细胞抗原表位(图12),Kyte-Doolittle法预测AH-F10-121氨基酸亲水性,在16-144,154-178,192-224,241-257,273-297区段的亲水性较强。Karplus-Schulz法预测柔韧性,结果显示有19个柔韧性区段,其中27-37,49-57,75-124,127-157,171-180,193-205,276-289区段柔韧性较强,易发生扭曲折叠,形成B细胞抗原表位的几率较高。Jameson-Wolf法预测抗原性,18-70,72-140,159-178,193-226,253-261,276-302区段抗原指数较高。Emini法预测表面可及性,其中40-52,101-120,193-202区段具有较高的表面可及性。对该蛋白的二级结构、亲水性、柔韧性、抗原性和表面可及性进行综合分析(表1),在20-37,40-57,61-70,73-142,159-166,170-178,193-222,276-292处可能存在B细胞表位。将单参数综合分析结果结合ABCpred[14-15](设置阈值为0.51)初步预测筛选肽段的结果(表2),综合分析预测在22-37,40-52,64-70,95-110,159-166,172-178,201-216,285-292区段可能存在B细胞优势表位。