《表1 本研究所用引物列表》
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《柱花草甲壳质酶基因SgGH19-1的克隆表达及酶学性质分析》
柱花草PR-3同源基因的克隆参照Liu等[15]的方法。首先,对不同植物中的PR-3基因进行多序列比对,包括拟南芥(Arabidopsis thaliana)的At3G12500(AtPR-3)、大豆(Glycine max)的Glyma02g04820、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的Medtr8g074330和菜豆(Phaseolus vulgaris)的Phvul.003G268500。根据这些基因的保守序列设计同源克隆引物SgPR-3-EST-F/R(表1),以热研2号柱花草的cDNA为模板,通过PCR扩增及测序获得柱花草PR-3同源基因的EST片段序列。随后,采用的SMARTerTM RACE cDNA Amplification Kit试剂盒(Clotech,美国)扩增柱花草PR-3基因的5′末端和3′末端。即根据获得的EST序列分别设计正向和反向引物SgPR-3-5′RACE-R和SgPR-3-3′RACE-F,分别与试剂盒中的通用引物RACE-UPM和RACE-NUP(表1)配对,通过RACE扩增得到5′和3′端序列,拼接后获得柱花草PR-3基因的cDNA全长序列,并用引物SgPR-3-ORF-F/R(表1)扩增全长序列。基因多序列比对、氨基酸序列比对和进化树构建分别采用DNAMAN、Clustal X和MEGA5软件。根据同源比对结果,将柱花草PR-3基因命名为SgGH19-1。
图表编号 | XD006266000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.25 |
作者 | 刘攀道、吴喜鹊、罗佳佳、许文茸、刘国道 |
绘制单位 | 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、农业农村部华南作物基因资源与种质创制重点实验室、海南大学理学院化学系、中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、农业农村部华南作物基因资源与种质创制重点实验室、海南大学理学院化学系、中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、农业农村部华南作物基因资源与种质创制重点实验室 |
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