《表1 本研究所用引物序列》

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《马铃薯低温响应的ScmiR390-5p及其靶基因表达与结构分析》

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采用Illumina Hi SeqTM2500测序平台对样本进行转录组和mi RNA高通量测序，以马铃薯（PGSC＿DM＿v4.03）为参考基因组，根据|log2 FC|≥1和FDR≤0.01比较、筛选差异表达基因（Differentially expressed genes，DEGs），与mi RBase数据库进行比对—注释，将序列与mi RBase中该miRNA成熟体序列进行无错配比对，比对上的序列定义为已知的miRNA。并以此为依据作为miRNA的表达量统计，进行DEGs分析。结果发现，低温驯化后期（8、9和10 d，图1-A) 106个miRNA上调，11个miRNA下调。其中8个上调miRNA的靶基因表现为显著下调；3个上调miRNA的靶基因在转录组分析中表现为显著上调；11个下调mi RNA的靶基因中有2个在转录组分析中表现为显著上调。进入霜冻处理，与对照材料比较，驯化后的材料霜冻处理早期（前1、2和3 h，图1-B) 65个miRNA上调，238个mi RNA下调。其中4个上调mi RNA的靶基因在转录组分析中表现为显著下调；6个上调mi RNA的靶基因在转录组分析中表现为显著上调。